Phạm vi phân bố của chuột bãi biển Alabama trong lịch sử bao gồm nhiều bán đảo Fort Morgan trên bờ vịnh Alabama và kéo dài từ Ono Island đến Fort Morgan. Phát triển nhà ở, hoạt động thương mại ven biển và xây dựng tuyến đường đã làm phân mảnh và phá hủy môi trường sống của phân loài này. Bão, bão nhiệt đới và cồn cát sử dụng của người đi bộ cũng làm hư hại hoặc phá huỷ cồn cát và môi trường sống liên quan. Bị rình rập bởi mèo nhà và mèo hoang cũng như các loài động vật khác, cộng với sự cạnh tranh từ những loài gặm nhấm khác cũng góp phần làm giảm số lượng chuột bãi biển Alabama.